Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms