Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM5Q9C035 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms