Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BARHL1Q9BZE3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms