Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PACSIN1Q9BY11 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN1Q9BY11 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms