Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALN1Q9BXU9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms