Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms