Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms