Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms