Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf50Q9BV19 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms