Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf16Q9BUW7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms