Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT17Q9BSW7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT17Q9BSW7 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT17Q9BSW7 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT17Q9BSW7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT17Q9BSW7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT17Q9BSW7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT17Q9BSW7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT17Q9BSW7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT17Q9BSW7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYT17Q9BSW7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms