Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MESP1Q9BRJ9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms