Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms