Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKP4Q99569 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKP4Q99569 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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