Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3AQ96ST3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms