Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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