Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX18Q96RF0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms