Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms