Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNFT2Q96EX2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms