Protein–RNA interactions for Protein: Q96E52

OMA1, Metalloendopeptidase OMA1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OMA1Q96E52 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OMA1Q96E52 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OMA1Q96E52 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms