Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms