Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG2BQ96BY7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms