Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2A3Q93084 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms