Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms