Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
COPS9Q8WXC6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms