Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF182Q8N6D2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms