Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMB4Q86W47 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms