Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD163Q86VB7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms