Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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UBE2Q1Q7Z7E8 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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UBE2Q1Q7Z7E8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2Q1Q7Z7E8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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