Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT28Q7Z3Y7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms