Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHA9Q7RTU4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms