Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC141Q6ZP82 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC141Q6ZP82 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms