Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms