Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SAMD13Q5VXD3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SAMD13Q5VXD3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAMD13Q5VXD3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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