Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF220Q5VTB9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms