Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PRAMEF20Q5VT98 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PRAMEF20Q5VT98 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PRAMEF20Q5VT98 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF20Q5VT98 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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