Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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