Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms