Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP188Q5SRE5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms