Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms