Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms