Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSD17B12Q53GQ0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms