Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACSM3Q53FZ2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms