Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF3Q3KNV8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms