Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms