Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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NDUFA9Q16795 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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NDUFA9Q16795 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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NDUFA9Q16795 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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NDUFA9Q16795 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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NDUFA9Q16795 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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NDUFA9Q16795 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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NDUFA9Q16795 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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NDUFA9Q16795 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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NDUFA9Q16795 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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NDUFA9Q16795 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms