Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECM1Q16610 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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