Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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GRIK5Q16478 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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