Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTRK3Q16288 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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