Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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ZNF56Q15929 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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ZNF56Q15929 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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ZNF56Q15929 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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ZNF56Q15929 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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ZNF56Q15929 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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ZNF56Q15929 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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ZNF56Q15929 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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